Servicii analiză proteomică DIA (SWATH-MS): achiziţie, procesare date şi analiză statistică pentru identificare specii, analiză cantitativă proteomică diferenţială, pentru 1200 de probe. Caracteristici: • Serviciile de analiză proteomică se realizeză din probe de peptide (volum ~20 μL), obţinute în urma digestiei cu tripsină din extract proteic, furnizate de benificiar. • Utilizarea unui spectrometru de masă (qTOF-MS, AB S...

Servicii analiză proteomică DIA (SWATH-MS): achiziţie, procesare date şi analiză statistică pentru identificare specii, analiză cantitativă proteomică diferenţială, pentru 1200 de probe. Caracteristici: • Serviciile de analiză proteomică se realizeză din probe de peptide (volum ~20 μL), obţinute în urma digestiei cu tripsină din extract proteic, furnizate de benificiar. • Utilizarea unui spectrometru de masă (qTOF-MS, AB SCIEX Triple TOF 5600+) de înaltă rezoluţie şi sensibilitate adecvată (sub 5 ppm) pentru analize proteomice. • Achiziţia MS se realizează printr-o metodă de tip SWATH-MS – Data Independent Acquisition (DIA). • Sistemul cromatografic pe care se realizează separarea peptidelor (NanoLC 425, Eksigent) este de tip micro- /nano-flow la care este conectată o coloană cromatografică cu faza staţionară de tip C18. • Procesarea de date şi analiza statistică se realizează la un false discovery rate (FDR) < 0.01. • Analize detaliate pentru confirmarea speciei identificate pe baza profilului proteomic obţinut. • Livrabile: o Datele de achiziţie MS în format *wiff. o Datele procesate obţinute în urma achiziţiei DIA-MS în format *csv /*xlsx. o Rapoarte de analiză statistică în format *csv /*xlsx, ce includ identificarea proteinelor diferenţial exprimate (cu numele întregi /forma lungă a proteinelor) şi valoarea p corespunzătoare pentru fiecare proteină din raport. o Heatmap (în format *pdf /*jpg) pentru analiza diferenţială în care se evidenţiază nivelule de expresie (în f

Arata tot

Arata mai putin